A t�rzsr�l �s a gy�kerekr�l: A jap�n bonsai fa r�szei: a f�gy�k�r, mell�kgy�kerek, a t�rzs, vessz�k �s �gak, levelek �s a r�gyek. A gy�k�rrel (az er�teljesebb, vastagabb) kapaszkodik a fa a f�ldben, a mell�kgy�kerek, melyek a gy�kerek utols� 10 cm-es szakasz�n vannak, (hajsz�lgy�kerek) a v�z �s t�panyagfelv�teln�l van nagy szerep�k, illetve a oxig�nfelv�teln�l, ugyanis a gy�kerek is l�legeznek. Nagyon fontos, hogy a bonsai sose legyen pang� v�zzel teli ed�nyben, mert �gy a gy�kerek nem tudnak l�legezni. Ezut�n k�vetkezik a gy�k�rnyak, mely a gy�k�rzet �s a t�rzs k�z�tti r�sz, majd a t�rzs, melyet k�v�lr�l el�regedett h�ncsr�teg bor�t. Ez v�di a fatestet a k�rtev�kt�l �s az id�j�r�si viszontags�gokt�l. Ezut�n pedig az �gak, vessz�k, levelek �s r�gyek k�veteznek.

R�gyek: A bonsai fa �sszes f�ld feletti r�sze a r�gyben megtal�lhat� kezdem�nyk�nt. A hajt�s �s lev�lr�gyek �ltal�ban hegyesek, m�g a vir�gr�gyek t�bbnyire leg�mb�ly�tettek. Van olyan eset is, amikor a r�gy nem hajt ki, nyugalmi �llapotban marad. Ha az akt�v r�gyek a fagyok miatt elfagynak ezek az alv�r�gyek aktiviz�l�dnak. A cs�csr�gy a hajt�s v�g�n van, a hajt�s n�vel�s�ben van szerepe. Az oldalr�gyek t�bbnyire gyeng�bbek, ezek biztos�tj�k a n�v�ny oldalir�ny� terjeszked�s�t. A mell�kr�gyek pedig nem t�l gyakori k�pz�dm�nyek. A cs�csr�gy mellett helyezkednek el, �s csak akkor hajtanak ki, ha a cs�csr�gy elpusztul.

Levelek: Eszt�tikailag van fontos szerepe a lev�lnek, sz�pp�, tetszet�sebb� teszi a n�v�nyt. Egy bonsai eset�ben is sz�ks�ges, hogy legyen lev�l, mert ezzel is szebb� tessz�k munk�nkat, viszont t�l soknak sem szabad lennie, a szemnek kellemes l�tv�nyt kell adnia egy bonsai f�nak, ez�rt csak m�rs�kelten lehetnek rajta levelek. A lev�l lev�llemezekb�l �ll, mely erezetes, s a lev�llemez lev�lny�lhez csatlakozik, mely a sz�rhoz k�ti a levelet. M�dosulhatnak, �talakulhatnak, feny�t�v�, t�viss�, kaccs�, h�sos pikkelly�, vagy a vir�gnak valamilyen r�sz�v�.

Az aljn�v�nyzet, "kis erd�": Az erd��ltet�s az egyik olyan �r�m, mellyel a m�r n�mi tapasztalatot szerzett bonsai k�sz�t� meglepi mag�t. Olyan fajokat alkalmazzuk, melyek alkalmasak a csoportos �lethez, �s a t�rsakkal megosztott, korl�tozott f�ldmennyis�ghez. Nem tan�csos k�l�nb�z� fajokb�l kialak�tani a "kis erd�t". Az egy fajb�l �ll� ligetek ugyanolyan sz�pek, �s l�nyegesen k�nnyebben gondozhat�k. Az aljn�v�nyzet amellett, hogy sz�pp� teszi alkot�sunkat, cs�kkenti a v�zp�rolg�st, �s �nt�z�sn�l nem mos�dik ki k�nnyen a f�ld. A jap�n kert�szek �ltal leggyakrabban haszn�lt aljn�v�nyzetet alkot� fajok a moh�k. Csak az �vegh�zb�l beszerezett mohafajok b�rj�k a szobah�m�rs�kletet. Az bonsai aljn�v�nyzet�nek kialak�t�s�n�l ker�lj�k a zs�folts�got.